سيستم جامع اسناد پزشكي، وظيفه نگهداري و بررسي اسناد و مدارك پزشكي طرفهاي قرارداد و نيز بيمه شدگان تأمين اجتماعي (بيماران خاص، پرونده اي وحضوري) و انجام امور مربوط به عقد قرارداد با مراكز درماني را عهده دار است.
كه بصورت كلي داراي اجرايي همچون پذيرش صورتحساب وتقسيم نسخ بين كارشناسان؛ عمليات رسيدگي به نسخ، مميزي نسخ كارشناس مسئول و تائيد كسورات، حسابداري و صدور چك، عقد قرداد و فيشيه طرفهاي قرارداد، تشكيل پرونده و رسيدگي به درخواستهاي بيماران خاص، خسارات متفرقه و همچنين ارائه انواع گزارشات آماري و تحليلي ميباشد